关联公司的经营对公司的财务来说相当复杂，主要是在公司的税务处理上，因为增值税不仅包括销售产生的增值税，还包括采购产生的进项税和所得税。
因此：
1、要考虑承担应缴的增值税。如果没有进项增值税票的话可协商去支付多少个百分比的增值税给挂靠的公司，这样子之后不需再核算每笔的业务所产生的增值税了；
2、应考虑需要承担应缴的所得税。这方面可以协商用费或票据来抵消利润，从而不需缴纳企业的所得税；
3、资金分开使用容易：另外设立一个专门结算的帐号，自己控制的私人印鉴；
4、挂靠协议对外的法律的效力比较低，所以最好以挂靠公司业务的部门形式表现，不然公司所在地的税务的部门会认为挂靠的公司有虚开增值税的行为，这会导致处罚。
如果是因挂靠的地址而产生的法律后果，挂靠的当事人需依法对法律后果承担相应的民事责任。
